Multiplex SNaPshot SNP分型法

SNP（single nucleotide polymorphism）原理

    SNP（single nucleotide polymorphism），即單核苷酸多態(tài)，是由于單個(gè)核苷酸改變而導(dǎo)致的核酸序列多態(tài)。一般來(lái)說(shuō)，一個(gè)SNP位點(diǎn)只有兩種等位基因，因此又叫雙等位基因。SNP在人基因組中的發(fā)生頻率比較高，大約平均每1000個(gè)堿基中就有一個(gè)多態(tài)位點(diǎn)，是繼微衛(wèi)星之后的第三代遺傳標(biāo)記。有些SNP位點(diǎn)還會(huì)影響基因的功能，從而導(dǎo)致生物性狀改變甚至致病。SNP廣泛用于群體遺傳學(xué)研究（如生物的起源、進(jìn)化及遷移等方面，將逐漸取代微衛(wèi)星而成為新一代的分子生物學(xué)標(biāo)記）和疾病相關(guān)基因的研究，在藥物基因組學(xué)、診斷學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中起重要作用。

Multiplex SNaPshot SNP分型法

SNaPshot SNP分型法

    是基于熒光標(biāo)記單堿基延伸原理的分型技術(shù)，也稱小測(cè)序，主要針對(duì)中等通量的SNP分型項(xiàng)目。在一個(gè)含有測(cè)序酶、四種熒光標(biāo)記ddNTP、緊臨多態(tài)位點(diǎn)5’-端的不同長(zhǎng)度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應(yīng)體系中，引物延伸一個(gè)堿基即終止，經(jīng)ABI測(cè)序儀檢測(cè)后，根據(jù)峰的移動(dòng)位置確定該延伸產(chǎn)物對(duì)應(yīng)的SNP位點(diǎn)，根據(jù)峰的顏色可得知摻入的堿基種類，從而確定該樣本的基因型。對(duì)于PCR產(chǎn)物模板可通過(guò)多重PCR反應(yīng)體系來(lái)獲得。通常用于10-30個(gè)SNP位點(diǎn)分析。

SNaPshot SNP分型法服務(wù)流程

 1. 客戶提供：

 1）.已純化基因組DNA，并填寫詳細(xì)基因組DNA量，濃度及純度

 2）.或提供新鮮的組織，血液，細(xì)胞樣本；且盡量多的材料

 3）.提供已知的基因序列或物種基因序列號(hào)；盡可能詳細(xì)的背景資料。

2.設(shè)計(jì)PCR 擴(kuò)增含SNPs 位點(diǎn)的一段DNA序列。

3.對(duì)PCR 產(chǎn)物進(jìn)行純化（去除引物和dNTP）。

4.引物延伸。

5.延伸產(chǎn)物測(cè)序。

6.提供：峰圖文件（abl.格式），序列文件（seq.格式）；正式的數(shù)據(jù)分析報(bào)告。

樣本運(yùn)輸：

  客戶根據(jù)溫度，所在區(qū)域及樣本類型的差異，以加冰袋或干冰運(yùn)輸，并保證樣本的密封性和完整性，以免造成不必要的污染和損耗。